No hace falta que pidas la junta de un mk3, si vas a comprar para tu mk2 ya te darán la nueva, la de goma. Ese es un problema conocido por VW y ya cambiaron la junta. Quizá, como dice AntonZG, sea la misma que la del mk3, pero si piedes para tu mk2 te daran la buena seguro.
Si te sirve para animarte
Cambiar la junta de la tapa de la culta es muy sencillo. No hice fotos de la junta nueva, pero es de una sola pieza y de goma. En la última foto se ve la junta que se montaba antes, en 3 piezas y una de ellas de corcho, vamos un desastre. Junto con la nueva junta también te darán los espárragos, pues los que hay ahora no te sirven, llevan como una arandela incorporada que hará que no puedas poner la nueva junta, pues los agujeros para los tornillos son más pequeños, por eso deberás cambiar los espárragos.
Como consejo te diré que no aprietes los tornillos mucho, y aprietalos todos igual. Si no tienes llave dinamométrica toma una referencia, por ejemplo, apreta hasta que notes que empiezas a hacer fuerza y entonces le das media vuelta a la llave, y haces lo mismo con todas las tuercas. Aprietalos poco, y si pierde siempre tendrás tiempo de apretarlos un poco más, en cambio si te pasas joderás la junta y tendrás que poner otra nueva. Piensa que los tornillos van muy flojitos (10 Nm, por si te sirve de algo) , sólo con apretar un poco la tapa sobre la junta de goma ya es suficiente para garantizar la estanqueidad.
Respecto a lo del refrigerante, pues si ya has cambiado maguitos antes, ya sabes de que va.